รองศาสตราจารย์ ดร. ธรรมศักดิ์ ยีมิน ปัจจุบันดำรงตำแหน่งคณบดีคณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยรามคำแหง และนายกสมาคมวิทยาศาสตร์ทางทะเลแห่งประเทศไทย (Marine Science Association of Thailand)
ตลอดระยะเวลากว่า 30 ปีที่ผ่านมา ท่านได้ทำงานด้านนิเวศวิทยา ชีววิทยา วิทยาศาสตร์สิ่งแวดล้อม เศรษฐกิจและสังคม การจัดการระบบนิเวศชายฝั่ง และการบริหารจัดการพื้นที่คุ้มครองทางทะเล ทั้งในประเทศไทยและภูมิภาคแปซิฟิกตะวันตก โดยมีบทบาทสำคัญในการสนับสนุนการบริหารจัดการทรัพยากรทางทะเลและชายฝั่งแก่หน่วยงานต่าง ๆ ทั้งในระดับท้องถิ่น ระดับประเทศ องค์กรระหว่างประเทศ และองค์กรพัฒนาเอกชน ท่านมีประสบการณ์ในการให้คำปรึกษาและสนับสนุนการจัดทำแผนบริหารจัดการทรัพยากรชายฝั่งและสิ่งแวดล้อมทางทะเล เพื่อส่งเสริมการใช้ประโยชน์ทรัพยากรอย่างยั่งยืนและการอนุรักษ์ความหลากหลายทางชีวภาพในพื้นที่ชายฝั่งและทะเลในระดับนานาชาติ
รองศาสตราจารย์ ดร. ธรรมศักดิ์ เคยดำรงตำแหน่งผู้ประสานงานระดับชาติ (National Focal Point) และประธานคณะทำงานระดับภูมิภาคด้านแนวปะการัง ภายใต้โครงการของโครงการสิ่งแวดล้อมแห่งสหประชาชาติและกองทุนสิ่งแวดล้อมโลก (UNEP/GEF) เรื่อง “การฟื้นฟูและแก้ไขแนวโน้มความเสื่อมโทรมของสิ่งแวดล้อมในทะเลจีนใต้และอ่าวไทย” ซึ่งเป็นโครงการความร่วมมือสำคัญของประเทศในภูมิภาคเอเชียตะวันออกเฉียงใต้ นอกจากนี้ ท่านยังเป็นหนึ่งในผู้ร่วมก่อตั้งสมาคมแนวปะการังแห่งเอเชียแปซิฟิก (Asia Pacific Coral Reef Society) และเคยดำรงตำแหน่งกรรมการสภาสมาคมแนวปะการังนานาชาติ (International Coral Reef Society: ICRS) ซึ่งเป็นองค์กรวิชาการชั้นนำของโลกด้านการศึกษาและอนุรักษ์แนวปะการัง
รองศาสตราจารย์ ดร. ธรรมศักดิ์ ยังมีบทบาทสำคัญในโครงการความร่วมมือระดับภูมิภาคภายใต้การสนับสนุนขององค์กรระหว่างประเทศหลายแห่ง อาทิ ศูนย์ความหลากหลายทางชีวภาพอาเซียน (ASEAN Centre for Biodiversity: ACB) คณะกรรมาธิการสมุทรศาสตร์ระหว่างรัฐบาลประจำภูมิภาคแปซิฟิกตะวันตก (IOC/WESTPAC) และองค์การทางทะเลระหว่างประเทศ (International Maritime Organization: IMO)
ด้วยความเชี่ยวชาญด้านนิเวศวิทยาทางทะเล แนวปะการัง การจัดการทรัพยากรชายฝั่งและทะเล ตลอดจนการอนุรักษ์ความหลากหลายทางชีวภาพ รองศาสตราจารย์ ดร. ธรรมศักดิ์ ยีมิน ได้รับการยอมรับอย่างกว้างขวางทั้งในระดับประเทศและนานาชาติ และมีบทบาทสำคัญในการขับเคลื่อนองค์ความรู้ทางวิทยาศาสตร์เพื่อสนับสนุนการบริหารจัดการทรัพยากรทางทะเลอย่างยั่งยืนของประเทศไทยและภูมิภาคเอเชียแปซิฟิก